分子是具有自身化学性质的最小的化学元素或化合物。分子又被化学建联在一起的原子组成。这些化学建来源于原子间共用电子的结果。　　

特定的已经与其它原子联在一起的原子形成分子。这种元素的例子是氧和氯。有些元素的原子不易和其他原子联在一起，例如氖和氩。　　

不同的分子在大小和复杂性上可以有很大的差别。氦元素是单原子分子。有些分子由两个相同元素的原子组成。例如，O2是在地球大气中最常见的分子。 在某种情况下，三个氧原子在一起形成臭氧分子。其他熟悉的分子包括水（有两个氢原子和一个员工原子组成）、二氧化碳（由两个氧原子和一个碳原子组成）和硫磺酸（由两个氢原子，一个硫原子和四个氧原子组成）。一些分子例如某些蛋白质，包含成百甚至成千的原子结合在一条链上，可以得到很大的长度。包含这种分子的液体的行为有时很奇怪。例如，有些液体当从瓶子流出一部分后，即使把瓶子竖起来，液体也能够继续流出。　　

分子总是在不停的运动。在固体中，分子的运动是快速的震动。在液体中，分子以有些不稳定的方式自由的流动。在气体中，分子的密度一般比在固体或液体中小，它们的运动比在液体中更加自由。对于给定状态下（固体，液体或气体）的特定化合物，分子运动的速度随着绝对温度的升高而加大。